【服务介绍】DNA甲基化是衰老过程中的一种重要表观遗传变化。伴随着衰老的加剧，某些特定的甲基化位点（CpG）会显示出与年龄相关的动态变化。通过将这些随年龄变化的CpG位点应用机器学习，构建出预测甲基化年龄的数学模型，这一模型被称为表观遗传时钟。该时钟能够量化生物体衰老的速度，并评估长寿与抗衰老干预措施的效果。

在此背景下，尊龙凯时对100只小鼠的血液基因组DNA进行了初步检测，分析了数百个与衰老相关的甲基化位点，建立了一个综合多种生物样本和衰老相关甲基化位点随小鼠月龄变化的数据库。通过机器学习，我们筛选出了一些在小鼠月龄显著变化且相关性强的甲基化位点，从而构建了高效的甲基化年龄预测器。

利用这一甲基化年龄预测器，我们预测了经过生殖压力的雌性小鼠的甲基化年龄，这进一步验证了我们方案的实用性。

【合作方式】技术服务

【检测对象】

物种样本类型：小鼠血液，雌性/4个，雄性/3个

【技术方案】

目标区间的甲基化重测序（Hi-Methylseq）结合亚硫酸盐转化和靶向扩增子高通量测序技术，实现了多区域、多位点的甲基化精确定量分析。

【服务流程】

【检测结果展示】

Ø 显著性评估：甲基化位点随小鼠月龄变化的显著性

Ø 预测生殖压力雌性小鼠的甲基化年龄

曹氏基因甲基化年龄预测模型：甲基化年龄（月）及加速效应（月）

衰老加速组甲基化水平（实际年龄18月龄）：440596727305

自然衰老组甲基化水平（实际年龄18月龄）：373525823669172221681824

需要指出的是，该甲基化预测模型为多元一次方程式。在检测小鼠样本的甲基化年龄时，只需将选定甲基化位点的甲基化水平代入该模型，即可得出该生物样本的甲基化年龄。我们通过这一模型预测自然衰老组小鼠（实际年龄18月龄）的甲基化年龄为1824月龄，而经过多次生殖压力的雌性小鼠（实际年龄18月龄）则为222月龄，衰老加速了396个月。

【参考文献】

[1] Rivero-Segura NA, Bello-Chavolla OY, Barrera-Vázquez OS, et al. Promising biomarkers of human aging: In search of a multi-omics panel to understand the aging process from a multidimensional perspective. Ageing research reviews, 2020, 64:101164

[2] Petkovich DA, Podolskiy DI, Lobanov AV, et al. Using DNA methylation profiling to evaluate biological age and longevity interventions. Cell metabolism, 2017, 25(4):954-960e6

[3] Stubbs TM, Bonder MJ, Stark AK, et al. Multi-tissue DNA methylation age predictor in mouse. Genome biology, 2017, 18:1-14

[4] Wang Y, Karlsson R, Lampa E, et al. Epigenetic influences on aging: a longitudinal genome-wide methylation study in old Swedish twins. Epigenetics, 2018, 13(9):975-987